Herramientas / Métodos

Herramientas metodológicas

Métodos estadístico-epidemiológicos y predictivos desarrollados por el CA, en R y Python, para apoyar la decisión clínica y el análisis poblacional.

Estadística

WISCA bayesiano

Antibiograma de incidencia ponderada por síndrome (modelo bayesiano).

RbrmsStan
Epidemiología de infecciosas Activa

Predictiva

Dengue Forecast

Pronóstico probabilístico y alerta temprana de dengue para los 32 estados de México.

RGradient boostingBayesianConformal prediction
Epidemiología de infecciosas En desarrollo

Pipeline

Pipeline de genómica microbiana (WGS)

Ensamblado, tipificación y resistencia genotípica desde secuenciación.

NextflowSPAdesABRicatePython
Biología molecular y biomarcadores Activa

Estadística

Series de tiempo epidemiológicas

Tendencias, estacionalidad y número reproductivo de enfermedades.

REpiEstimforecast
Ciencia de datos poblacionales Activa

Estadística

Análisis espacial y determinantes poblacionales

Autocorrelación espacial y determinantes a escala municipal.

Rsfspdep
Ciencia de datos poblacionales En desarrollo

Stack R · Python · Stan / brms · sf · spdep · EpiEstim · Nextflow · tidyverse