Métodos y aplicaciones

Herramientas del Cuerpo Académico

Docente

Diagnóstico microbiológico médico

Material interactivo de Microbiología I: de la muestra al resultado, con simuladores, casos y autoevaluación.

HTMLSVGJavaScript
Epidemiología de infecciosas Activa

Estadística

Propedéutica médica basada en evidencia

Buscador de signos de exploración física con su rendimiento diagnóstico medido.

PythonJavaScriptPubMedCrossref
Clínica, epidemiológica y traslacional Activa

Docente

VIROLOGÍA

Herramienta con estrategias de aprendizaje activo en Virología.

HTMLSVGJavaScript
Epidemiología de infecciosas Activa

Estadística

WISCA bayesiano

Antibiograma de incidencia ponderada por síndrome (modelo bayesiano): el antibiótico correcto desde la primera dosis.

RbrmsStanHTMLJavaScript
Epidemiología de infecciosas Activa

Predictiva

Dengue Forecast

Pronóstico probabilístico y alerta temprana de dengue para los 32 estados de México.

RGradient boostingBayesianConformal prediction
Epidemiología de infecciosas Beta

Pipeline

Pipeline de genómica microbiana (WGS)

Ensamblado, tipificación y resistencia genotípica desde secuenciación.

NextflowSPAdesABRicatePython
Biología molecular y biomarcadores Activa

Estadística

Series de tiempo epidemiológicas

Tendencias, estacionalidad y número reproductivo de enfermedades.

REpiEstimforecast
Ciencia de datos poblacionales Activa

Estadística

Análisis espacial y determinantes poblacionales

Autocorrelación espacial y determinantes a escala municipal.

Rsfspdep
Ciencia de datos poblacionales En desarrollo

Stack R · Python · Stan / brms · sf · spdep · EpiEstim · Nextflow · tidyverse

Sección · Laboratorio clínico

Laboratorio

Serie «Del tubo al diagnóstico»: consulta de biomarcadores, intervalos de referencia y verificación de resultados para químicos clínicos, responsables de calidad y médicos. Funcionan en el navegador y los datos capturados no salen de tu equipo.

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Consulta

Del tubo al diagnóstico: consulta de 60 biomarcadores

Qué es cada marcador, en qué tubo se toma, cómo se conserva y se mide, por qué sube o baja y cómo se interpreta.

HTMLJavaScriptCLSIEFLM
Clínica, epidemiológica y traslacional Activa

Estadística

Intervalos de referencia: verificar, establecer y transferir

¿El intervalo del inserto sirve para mi población y mi método? ¿Cómo construyo el mío?

JavaScriptCLSI EP28Harris–BoydrefineR
Ciencia de datos poblacionales Activa

Estadística

Delta check: comparar al paciente consigo mismo

¿Este cambio entre dos resultados del mismo paciente es real, es error o es ruido? Qué límite y qué ventana usar.

JavaScriptCLSI EP33EFLMRCV
Clínica, epidemiológica y traslacional Activa

Sección · Bioestadística abierta

Bioestadística abierta

Calculadoras explicadas para investigación clínica: cada una muestra la ecuación clásica, una explicación sencilla, la interpretación en lenguaje llano, el código de R equivalente y las fuentes originales. Calcula, entiende, cita. Los datos no salen de tu navegador.

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Estadística

Bioestadística abierta: pruebas diagnósticas

Sensibilidad, especificidad, valores predictivos y razones de verosimilitud desde una tabla 2×2; probabilidad posprueba con nomograma de Fagan.

TypeScriptRwebR
Clínica, epidemiológica y traslacional Beta

Estadística

Bioestadística abierta: asociación y efecto en tablas 2×2

Riesgo relativo, razón de momios, reducción absoluta del riesgo y NNT; χ², Fisher exacto y McNemar.

TypeScriptRwebR
Clínica, epidemiológica y traslacional Beta

Estadística

Bioestadística abierta: tamaño de muestra y poder

Estimar una proporción o una media, comparar dos proporciones o dos medias, precisión diagnóstica (Buderer) y correlación, con curvas de poder.

TypeScriptRwebR
Clínica, epidemiológica y traslacional Beta

Estadística

Bioestadística abierta: concordancia y descriptivos

Kappa de Cohen, IC de una proporción (seis métodos) y de una media, media y DE a partir de la mediana, descriptivos con gráfica.

TypeScriptRwebR
Clínica, epidemiológica y traslacional Beta

Estadística

Bioestadística abierta: modelos de regresión y supervivencia

Kaplan-Meier con IC de Greenwood, mediana y log-rank, ya disponible; regresión logística, Cox y lineal con R en el navegador (webR), en preparación.

TypeScriptRwebR
Clínica, epidemiológica y traslacional Beta